Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF5O00463 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF5O00463 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAF5O00463 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF5O00463 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms