Protein–RNA interactions for Protein: O00358

FOXE1, Forkhead box protein E1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE1O00358 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXE1O00358 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXE1O00358 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXE1O00358 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXE1O00358 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXE1O00358 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXE1O00358 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE1O00358 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXE1O00358 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms