Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIP1O00291 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIP1O00291 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIP1O00291 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIP1O00291 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIP1O00291 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIP1O00291 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIP1O00291 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIP1O00291 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIP1O00291 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIP1O00291 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIP1O00291 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIP1O00291 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HIP1O00291 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIP1O00291 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIP1O00291 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIP1O00291 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIP1O00291 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIP1O00291 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIP1O00291 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIP1O00291 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIP1O00291 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIP1O00291 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HIP1O00291 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIP1O00291 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIP1O00291 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIP1O00291 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIP1O00291 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIP1O00291 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIP1O00291 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIP1O00291 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIP1O00291 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIP1O00291 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIP1O00291 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIP1O00291 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIP1O00291 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIP1O00291 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIP1O00291 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HIP1O00291 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HIP1O00291 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIP1O00291 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIP1O00291 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIP1O00291 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIP1O00291 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HIP1O00291 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIP1O00291 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIP1O00291 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIP1O00291 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIP1O00291 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIP1O00291 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIP1O00291 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIP1O00291 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIP1O00291 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIP1O00291 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HIP1O00291 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIP1O00291 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIP1O00291 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIP1O00291 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIP1O00291 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIP1O00291 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIP1O00291 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIP1O00291 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIP1O00291 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIP1O00291 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIP1O00291 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HIP1O00291 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIP1O00291 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIP1O00291 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIP1O00291 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms