Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms