Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms