Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BNC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BNC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BNC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
H3BNC9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BNC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BNC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BNC9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BNC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BNC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BNC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BNC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BNC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BNC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BNC9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BNC9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BNC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BNC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BNC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNC9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNC9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNC9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNC9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BNC9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BNC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BNC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BNC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BNC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BNC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
H3BNC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
H3BNC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BNC9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BNC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BNC9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BNC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BNC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BNC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BNC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BNC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BNC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BNC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BNC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BNC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BNC9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BNC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BNC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BNC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BNC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNC9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNC9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25■■□□□ 1.59
H3BNC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms