Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.8 ms