Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NACAE9PAV3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms