Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms