Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNJ18B7U540 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNJ18B7U540 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ18B7U540 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms