Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L5A8MUK1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
USP17L5A8MUK1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L5A8MUK1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms