Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOTOA8MTQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms