Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms