Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37CA5D8V6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms