Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0J9YVX5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms