Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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