Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms