Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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KLHL28Q9NXS3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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KLHL28Q9NXS3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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KLHL28Q9NXS3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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KLHL28Q9NXS3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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KLHL28Q9NXS3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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