Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATAD3AQ9NVI7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms