Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms