Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3GL3Q99963 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3GL3Q99963 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3GL3Q99963 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3GL3Q99963 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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