Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXPE2Q96DL1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms