Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms