Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C17orf47Q8NEP4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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C17orf47Q8NEP4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C17orf47Q8NEP4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C17orf47Q8NEP4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C17orf47Q8NEP4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C17orf47Q8NEP4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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C17orf47Q8NEP4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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