Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms