Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01545Q5VT33 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms