Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms