Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms