Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HADHQ16836 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HADHQ16836 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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