Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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