Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
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CTF1Q16619 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CTF1Q16619 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CTF1Q16619 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CTF1Q16619 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CTF1Q16619 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CTF1Q16619 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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