Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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