Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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DDB1Q16531 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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