Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CNGA3Q16281 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CNGA3Q16281 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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