Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms