Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.222e-8■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.322e-8■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.352e-8■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 COG5-209ENST00000484237 574 ntTSL 46.42□□□□□ -1.382e-8■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 COG5-208ENST00000475638 592 ntTSL 36.17□□□□□ -1.422e-8■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.42□□□□□ -1.73e-8■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.81e-6■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 CROCCP2-207ENST00000640476 1750 ntTSL 519.53■□□□□ 0.724e-15■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.095e-7■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 FOXRED2-202ENST00000366463 2489 ntTSL 212.39□□□□□ -0.435e-7■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 219.01■□□□□ 0.638e-7■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 CTIF-204ENST00000587769 547 ntTSL 410.45□□□□□ -0.743e-8■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 BCL2L2-205ENST00000557236 631 ntTSL 518.36■□□□□ 0.534e-8■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 MFHAS1-204ENST00000521881 577 ntTSL 318.3■□□□□ 0.529e-7■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.519e-7■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 RBBP6-212ENST00000570185 505 ntTSL 56.4□□□□□ -1.381e-9■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 RBBP6-205ENST00000562430 6482 ntTSL 1 (best)5.51□□□□□ -1.531e-9■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.611e-9■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.711e-9■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 218.06■□□□□ 0.489e-7■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 SLC26A6-206ENST00000414944 724 ntTSL 316.46■□□□□ 0.233e-6■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 SLC26A6-212ENST00000444531 806 ntTSL 315.06■□□□□ 03e-6■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 SLC26A6-208ENST00000421649 910 ntTSL 314.27□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 16.4
PCBP2Q15366 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.441e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DEDD-210ENST00000490843 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DEDD-209ENST00000489249 1116 ntTSL 26.47□□□□□ -1.371e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TSPYL1-201ENST00000368608 3326 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.557e-12■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.933e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 E2F4-208ENST00000567007 2615 ntTSL 218.23■□□□□ 0.513e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MLXIPL-207ENST00000453275 690 ntTSL 518.42■□□□□ 0.542e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 RNF220-209ENST00000474064 2734 ntTSL 220.63■□□□□ 0.892e-8■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 RNF220-214ENST00000484745 1951 ntTSL 516.96■□□□□ 0.312e-8■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 RNF220-211ENST00000474956 3303 ntTSL 212.13□□□□□ -0.472e-8■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 RNF220-213ENST00000480686 3835 ntTSL 212.06□□□□□ -0.482e-8■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.682e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TSPAN14-204ENST00000372157 855 ntTSL 518.89■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.422e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TSPAN14-208ENST00000469149 959 ntTSL 216.93■□□□□ 0.32e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)21.23■□□□□ 0.993e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 AES-208ENST00000587083 458 ntTSL 211.32□□□□□ -0.64e-8■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.441e-8■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-210ENST00000463094 796 ntTSL 218.57■□□□□ 0.562e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-215ENST00000482280 944 ntTSL 218.57■□□□□ 0.562e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-207ENST00000425703 694 ntTSL 517.39■□□□□ 0.372e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-206ENST00000423982 2706 ntTSL 513.93□□□□□ -0.182e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MSH5-211ENST00000463144 2296 ntTSL 510.02□□□□□ -0.812e-9■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.883e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 NINJ1-204ENST00000489274 2026 ntTSL 214.39□□□□□ -0.113e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.497e-43■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.437e-43■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.347e-43■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.297e-43■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 519.83■□□□□ 0.767e-43■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.37e-43■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.683e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MYADM-207ENST00000421337 1009 ntTSL 217.38■□□□□ 0.377e-40■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MYADM-209ENST00000448420 777 ntTSL 213.75□□□□□ -0.217e-40■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MYADM-206ENST00000414489 592 ntTSL 513.03□□□□□ -0.327e-40■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MYADM-208ENST00000439000 841 ntTSL 312.66□□□□□ -0.387e-40■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PKNOX1-202ENST00000418336 459 ntTSL 219.41■□□□□ 0.75e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PKNOX1-206ENST00000480179 1725 ntTSL 214.29□□□□□ -0.125e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.745e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.815e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-202ENST00000509700 870 ntTSL 510.94□□□□□ -0.662e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-203ENST00000636689 1184 ntTSL 58.35□□□□□ -1.072e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-209ENST00000640017 2968 ntTSL 28.08□□□□□ -1.122e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-210ENST00000640914 565 ntTSL 57.73□□□□□ -1.172e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.172e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-206ENST00000638840 3260 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.452e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.572e-20■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.482e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 RTKN-211ENST00000640304 612 ntTSL 514.9□□□□□ -0.024e-13■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PRRC2B-208ENST00000465931 5366 ntTSL 211.82□□□□□ -0.524e-12■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.177e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-323■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-323■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.454e-8■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.985e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PPP2R3B-203ENST00000445792 1998 ntTSL 226.06■■□□□ 1.765e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 WSB2-205ENST00000536738 824 ntTSL 325.91■■□□□ 1.745e-7■■■□□ 16.3
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