Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms