Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms