Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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