Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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SPIDRQ14159 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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