Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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