Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms