Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME3Q13232 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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