Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms