Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms