Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF3P78545 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF3P78545 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF3P78545 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF3P78545 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms