Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms