Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms