Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms