Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3P61158 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3P61158 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3P61158 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3P61158 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3P61158 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3P61158 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3P61158 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3P61158 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3P61158 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3P61158 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3P61158 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms